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BioSIFTR:利用生物群系特异性基因组目录从浅层鸟枪法测序推断功能,并在肠道微生物组中开展基准评估
BioSIFTR: functional inference from shallow shotgun sequencing using biome-specific genome catalogues benchmarked in gut microbiomes
AI 导读
BioSIFTR利用生物群系特异性基因组目录,从浅层鸟枪法测序推断微生物组功能,在肠道微生物组基准评估中优于同类方法。该方法将测序读段比对结果外推至15个MGnify目录的预计算泛基因组功能。在合成群落及红原鸡、小鼠和人类肠道微生物组中完成评估,进一步验证仍需配套基准数据集。
来源:Genome Biology · link.springer.com