Bioinformatics (OUP)·· 8 天前AI 评分53
hpci 将持续集成与高性能计算集群连接，用于计算生物学研究的可重复性检查
hpci improves reproducibility of computational biology research by integrating Continuous Integration with High Performance Computing clusters
AI 导读
研究团队开发了开源工具 hpci，将持续集成（CI）平台与高性能计算（HPC）集群连接，并在五种计算生物学工作流中展示其用途。hpci 支持 GitHub Actions、GitLab CI 及 Slurm、PBS，以普通用户权限通过 SSH 运行，无需在集群端安装；它在 CI 运行器上返回与 HPC 作业完全相同的退出码，并在出现错误时阻止后续 CI 步骤。
来源：Bioinformatics (OUP) · academic.oup.com