细胞自组织协调铁死亡传播
Cellular self-organization orchestrates ferroptosis propagation.
一句话在细胞模型中,自组织形成的敏感性差异与脂质极化分布共同限制铁死亡的传播范围和方向。
研究问题
数据与样本
实验流程
- 1空间模式与敏感性分析:考察不同细胞密度和排列区域的铁死亡敏感性及传播边界。
- 2转录程序关联分析:将区域敏感性与 YAP/TEAD1 活性及 NRF2 表达联系起来。
- 3脂质空间分布分析:考察细胞伸长、可氧化脂质极化分布及细胞两极过氧化热点与传播方向的关系。
- 4机制扰动验证:结合计算机模拟与药理学扰动,研究模式依赖性敏感性和脂质极化组织对传播范围及方向的共同作用。
关键方法与工具
- In silico
- 研究铁死亡传播机制
- pharmacological perturbations
- 扰动并检验传播机制
设计思路
主要发现
- 细胞自组织能够限制原本可呈无边界触发波形式传播的铁死亡。
- 低密度、排列不一致且 YAP/TEAD1 活性升高的区域对铁死亡敏感;高密度、排列一致且 NRF2 表达增加的区域形成抵抗传播的边界。
- 细胞伸长使可氧化脂质极化分布,在细胞两极形成过氧化热点,促进铁死亡沿细胞排列方向传播。
- 计算机模拟与药理学扰动表明,模式依赖性敏感性和脂质极化组织共同将各向同性传播限制为局限于特定空间的各向异性传播。
可借鉴之处
- 研究集体细胞死亡时,可借鉴本文按细胞密度与排列状态进行空间分区的思路,将局部敏感性与传播边界联系起来。
- 可同时考察群体尺度的空间模式与细胞内脂质分布,区分哪些区域允许传播以及传播沿哪个方向发生。
- 可借鉴计算机模拟与药理学扰动相结合的设计,检验多个空间机制是否共同解释观察到的传播行为。
数据与代码
局限
- 细胞模型中的机制发现不能直接等同于人体组织或疾病中的铁死亡传播规律。
摘要(中文翻译)
自组织产生引导形态发生的细胞模式,但其如何调控集体细胞命运仍缺乏充分研究。我们发现,细胞自组织限制铁死亡的传播;铁死亡是一种铁依赖性的氧化性细胞死亡形式,否则可作为无边界的触发波传播。细胞密度与排列的空间模式编码转录程序,使细胞预先倾向于铁死亡敏感或耐受的命运。YAP/TEAD1 活性升高的低密度、排列不一致区域对铁死亡敏感,而 NRF2 表达增加的高密度、排列一致区域则形成抵抗传播的边界。细胞伸长使可氧化脂质呈极化分布,在细胞两极形成过氧化热点,促进铁死亡沿细胞排列方向传播。计算机模拟与药理学扰动揭示,依赖空间模式的敏感性与极化的脂质组织共同作用,将各向同性的波限制为局限于特定空间的各向异性传播。这些发现表明,自组织是调控集体稳态的一种系统层面机制,为探索组织尺度的结构如何调控发育与疾病中的细胞死亡提供了范式。
英文原文摘要
Self-organization generates cellular patterns that guide morphogenesis, but how it regulates collective cell fate remains underexplored. We show that cellular self-organization constrains the propagation of ferroptosis, an iron-dependent form of oxidative cell death that can otherwise spread as unbounded trigger waves. The spatial patterning of cell density and alignment encodes transcriptional programs, priming cells toward ferroptosis-sensitive or -resistant fates. Low-density, misaligned regions with elevated YAP/TEAD1 activity are sensitive, whereas high-density, aligned regions with increased NRF2 expression form propagation-resistant boundaries. Cell elongation establishes a polarized distribution of oxidizable lipids, creating peroxidation hotspots at the cell poles that promote propagation along cell alignment. In silico and pharmacological perturbations reveal that pattern-dependent susceptibility and polarized lipid organization act together to constrain isotropic waves into spatially confined, anisotropic propagation. These findings identify self-organization as a systems-level mechanism governing collective homeostasis, providing a paradigm to explore how tissue-scale organization regulates cell death in development and disease.
摘要来自 PubMed。翻译与解读由模型根据摘要生成,可能有误,不构成诊疗建议;数据以原文为准,版权归原出版方所有。