Wang X等提出基因调控建模框架CellReg3D
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Wang X等提出基因调控建模框架CellReg3D
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AI 综述
Wang X等研究团队在预印本中提出CellReg3D,将DNA语言模型与Hi-C衍生的三维染色质互作数据结合,用于预测细胞类型特异性的基因调控;研究团队称,该框架在多种细胞类型的表观遗传标记和基因表达预测中达到当前领先水平。 CellReg3D同时建模局部DNA序列模式与远距离基因组互作。研究团队称,它还可用于识别细胞类型特异性调控机制、筛选功能性非编码变异,并辅助解释表达数量性状位点(eQTL)。
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最新进展11月4日 08:00
CellReg3D整合DNA大语言模型与三维基因组结构,解析细胞类型特异性基因调控报道时间线
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11月4日
- 预印本 · 医学生信与数据分析CellReg3D整合DNA大语言模型与三维基因组结构,解析细胞类型特异性基因调控
CellReg3D整合DNA语言模型与Hi-C衍生的三维染色质互作数据,在多种细胞类型的表观遗传标记和基因表达预测中达到当前领先水平。该多尺度、多模态深度学习框架还能识别细胞类型特异性调控机制、筛选功能性非编码变异,并辅助解释表达数量性状位点(eQTLs)。
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