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研究建立细胞内RNA结构与蛋白占据定量方法

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AI 综述

研究团队建立了基于硫酸二甲酯突变谱测序的定量框架,在人细胞中以单核苷酸分辨率测量RNA结构与RNA结合蛋白的结合情况,并在MS2发夹—衣壳蛋白体系中,将结构推算的蛋白占据率与RNA降解效率关联起来。 对含1600个成员的MS2发夹文库的分析显示,RNA折叠是MS2衣壳蛋白识别的最强决定因素;由结构读出推算的占据率可定量预测该体系中的RNA降解效率。

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报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

10月30日
  1. Nucleic Acids Research
    RNA发夹结构探测可量化RNA上的蛋白质占据率,并将其与人细胞内功能关联

    研究建立了基于硫酸二甲酯突变谱分析与测序的定量框架,以单核苷酸分辨率测量人细胞内RNA结构及RNA结合蛋白的结合情况。对含1600个成员的MS2发夹文库分析显示,RNA折叠是MS2衣壳蛋白识别的最强决定因素。由结构读出推算的占据率可定量预测RNA降解效率。

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