Pheno2Seq关联有孔虫形态与单细胞基因表达
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Pheno2Seq关联有孔虫形态与单细胞基因表达
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AI 综述
Sterner等研究者开发了Pheno2Seq,将荧光染色个体的成像与单细胞转录组分析结合,在有孔虫Allogromia laticollaris中识别出800多个与生命周期转换相关的差异表达基因;相关结果以预印本发布。 这种有孔虫的生命周期包含单倍体、二倍体交替及极端核内复制。研究发现,在极端核内复制的Zerfall阶段,转录组大体沉默,但参与基因组过程与稳定性的基因家族仍有表达。这些结果揭示了细胞核变化伴随的基因表达差异,尚不能据此确定驱动变化的因果机制。
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最新进展10月23日 08:00
利用 Pheno2Seq 阐明有孔虫生命周期中驱动细胞核动态变化的基因表达改变报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月23日
- 预印本 · 单细胞与空间组学利用 Pheno2Seq 阐明有孔虫生命周期中驱动细胞核动态变化的基因表达改变
Pheno2Seq结合荧光染色成像与单细胞转录组分析,在有孔虫Allogromia laticollaris中识别出>800个与生命周期转换相关的差异表达基因。极端核内复制的Zerfall阶段,转录组大体沉默,但参与基因组过程与稳定性的基因家族仍有表达。该方法可适配不同谱系,用于研究缺乏形态可辨生命周期阶段的微型真核生物。
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