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Pheno2Seq关联有孔虫形态与单细胞基因表达

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AI 综述

Sterner等研究者开发了Pheno2Seq,将荧光染色个体的成像与单细胞转录组分析结合,在有孔虫Allogromia laticollaris中识别出800多个与生命周期转换相关的差异表达基因;相关结果以预印本发布。 这种有孔虫的生命周期包含单倍体、二倍体交替及极端核内复制。研究发现,在极端核内复制的Zerfall阶段,转录组大体沉默,但参与基因组过程与稳定性的基因家族仍有表达。这些结果揭示了细胞核变化伴随的基因表达差异,尚不能据此确定驱动变化的因果机制。

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报道时间线

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10月23日
  1. 预印本 · 单细胞与空间组学
    利用 Pheno2Seq 阐明有孔虫生命周期中驱动细胞核动态变化的基因表达改变

    Pheno2Seq结合荧光染色成像与单细胞转录组分析,在有孔虫Allogromia laticollaris中识别出>800个与生命周期转换相关的差异表达基因。极端核内复制的Zerfall阶段,转录组大体沉默,但参与基因组过程与稳定性的基因家族仍有表达。该方法可适配不同谱系,用于研究缺乏形态可辨生命周期阶段的微型真核生物。

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