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研究团队提出转运蛋白底物特异性预测框架TraSPIN

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AI 综述

Tong Pan、Fuyi Li、Jiangning Song等研究团队提出TraSPIN,联合建模转运蛋白与小分子底物,以预测转运蛋白的底物特异性;团队报告,其预测表现优于现有方法,并能泛化至未见过的底物和序列差异较大的转运蛋白。 这一几何深度学习框架通过语言模型引导的图学习,识别与底物识别有关的结构决定因素和序列基序。团队还通过跨物种推断及未表征溶质载体蛋白的功能解析,展示了其用于功能注释的潜力。

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报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

10月15日
  1. Genome Biology
    TraSPIN:通过语言模型引导的图学习推断转运蛋白特异性

    TraSPIN联合建模转运蛋白与小分子底物,预测表现优于现有方法,并可泛化至未见底物及序列差异较大的转运蛋白。该几何深度学习框架揭示了转运蛋白识别底物的结构决定因素与序列基序,并通过跨物种推断和未表征溶质载体蛋白的功能解析,展示其功能注释用途。

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