图神经网络识别炎症性肠病相关微生物共丰度模块

Cunha AF等研究团队在预印本中报告，利用106人的纵向宏基因组数据构建微生物关联网络，并解读图神经网络，识别出与炎症性肠病预测相关的拟杆菌目共丰度模块；但图神经网络的预测性能低于基于丰度的随机森林模型。 研究数据来自HMP2/iHMP，随机森林与图神经网络的AUPRC分别约为0.59和0.446。该模块中的物种在组间没有差异丰度，但在独立队列中承载了大部分预测信号，移除其关联后，预测性能降至接近随机水平。研究团队认为，物种间的关联结构可补充仅考察丰度变化的分析。

AI 根据报道生成 · 47 分钟前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。