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研究团队开源单细胞数据处理与逐细胞质控工具

1 篇报道1 个报道来源1 天前更新

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AI 综述

Prabakar RK、Meyer HV研究团队开发并开源了gcat和its_a_scam,用于单细胞基因组数据的模块化处理与质量控制,并在预印本中介绍了这两款工具。 其中,its_a_scam可配合常用开源工具生成单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞染色质可及性测序(scATAC-seq)的计数矩阵,也可直接从比对文件开展逐细胞质量控制。两款工具均已在GitHub提供,gcat以gcatlib名称发布。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

11月4日
  1. 预印本 · 单细胞与空间组学
    gcat 与 its_a_scam 提供模块化单细胞数据处理和逐细胞质量控制工具

    研究团队开发了开源工具 gcat 和 its_a_scam,用于模块化处理单细胞基因组数据,并直接从比对文件开展逐细胞质量控制。

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