LineageFlow结合生长校正预测细胞命运
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LineageFlow结合生长校正预测细胞命运
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AI 综述
Liu Y等研究团队在预印本中提出LineageFlow框架,称其在谱系追踪造血数据的克隆不重叠评估中,细胞命运预测和基因表达分布预测的准确性优于匹配基线。 该框架结合连续时间细胞状态转变、相对净生长与状态条件生成流,从早期单细胞测量预测未来命运分布及转录谱。脐带血谱系数据经独立重训练后,在更长预测跨度下也显示类似优势。 团队的模拟结果显示,生长校正的收益取决于后代状态的扩增速率:不同状态扩增速率不同时可改善预测,等速生长时获益很小。
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最新进展10月19日 08:00
LineageFlow:用于细胞命运概率预测的生长校正状态动力学框架报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月19日
- 预印本 · 单细胞与空间组学LineageFlow:用于细胞命运概率预测的生长校正状态动力学框架
LineageFlow结合细胞状态转变、相对净生长与状态条件生成流,在谱系追踪造血数据的克隆不重叠评估中,命运预测及表达分布准确性优于匹配基线。脐带血谱系数据经独立重训练后,在更长预测跨度下也显示类似优势。模拟表明,生长校正仅在后代状态扩增速率不同时改善预测,等速生长时获益很小。
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