研究团队推出多线程单细胞分析工具brisc
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研究团队推出多线程单细胞分析工具brisc
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AI 综述
Arbabi K等研究团队推出多线程CPU单细胞分析工具包brisc,并在预印本中报告:在192-CPU节点上,brisc用3分钟完成1000万细胞的标准分析流程,速度为Scanpy的116倍,峰值内存占用不足其一半,速度为采用BPCells的Seurat的236倍。 brisc覆盖降维、数据整合、标签转移、聚类、嵌入、差异表达分析和绘图。团队另称,在96个CPU上,brisc的速度与使用4块H100 GPU的rapids-singlecell相当。
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最新进展11月4日 08:00
brisc 多线程 CPU 工具包可在 3 分钟内完成千万细胞标准分析流程报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月4日
- 预印本 · 单细胞与空间组学brisc 多线程 CPU 工具包可在 3 分钟内完成千万细胞标准分析流程
研究团队推出单细胞分析工具包 brisc,在 192-CPU 节点上用 3 分钟完成 1000 万细胞的标准工作流,比 Scanpy 快 116 倍,峰值内存占用不足其一半,比采用 BPCells 的 Seurat 快 236 倍。
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