研究团队提出亚群感知基因筛选方法DisTwiner
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研究团队提出亚群感知基因筛选方法DisTwiner
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AI 综述
Costa等研究团队在预印本中提出基因筛选方法DisTwiner;在年轻与衰老小鼠再生骨骼肌的巨噬细胞单细胞数据中,其分类性能与标准Elastic Net相近,优于所评估的Random Forest,并筛选出亚群差异更明显的基因。 该方法面向含多个已标注亚群的二分类任务,将亚群特异性的基因相关结构纳入正则化逻辑回归。研究团队使用模拟数据和上述小鼠数据进行评估,富集分析显示,所选基因涉及特定巨噬细胞群的干扰素应答等衰老相关通路。
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最新进展10月27日 08:00
基于正则化逻辑回归的基因筛选:用于肌肉衰老与再生中异质性巨噬细胞群的单细胞RNA测序功能分析报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月27日
- 预印本 · 单细胞与空间组学基于正则化逻辑回归的基因筛选:用于肌肉衰老与再生中异质性巨噬细胞群的单细胞RNA测序功能分析
DisTwiner将亚群特异性基因相关结构纳入正则化逻辑回归,在巨噬细胞单细胞数据中保持分类性能,并筛选出亚群差异更明显的基因。在年轻与衰老小鼠再生骨骼肌数据中,其分类性能与标准Elastic Net相近,优于所评估的Random Forest。富集分析显示,所选基因涉及特定巨噬细胞群的干扰素应答等衰老相关通路。
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