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研究团队提出重编程候选调控因子筛选工具FateDriver

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AI 综述

Sung J等研究团队提出FateDriver,用于为特定源细胞向目标细胞的重编程转变排序候选调控基因;预印本报告,在两个OSKM数据集和一个GMT数据集中,其参考基因找回表现位列六种方法的第一或第二。 该工具采用弱监督双视图图神经网络,结合单细胞转录组与实验导入因子的稀疏标签,为其余基因排序。在两个OSKM数据集中,它对诱导多能性化学组合的蛋白靶点也取得了最高找回表现。

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报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

11月1日
  1. 预印本 · 单细胞与空间组学
    FateDriver:利用弱监督双视图图学习,针对特定细胞重编程转变优先筛选候选调控因子

    FateDriver利用单细胞转录组和实验导入因子的稀疏标签,针对特定细胞重编程转变优先筛选候选调控基因。在两个OSKM数据集和一个GMT数据集中,其参考基因找回表现位居六种方法的第一或第二,并在两个OSKM数据集中对诱导多能性的化学组合蛋白靶点取得最高找回表现。

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还没有足够的连续观测数据,暂不绘制趋势。