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横断面转录组推断衰老基因互作,部分获实验验证

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AI 综述

Krieger MS等研究团队在预印本中报告,利用490名GTEx供者的皮肤成纤维细胞横断面转录组数据推断衰老相关基因因果网络,并通过实验验证了53.8%的可检验预测互作。 研究采用收敛交叉映射(CCM),结合网络结构和随年龄变化的基因表达筛选候选衰老驱动基因,再在55岁供者的成纤维细胞中进行单基因过表达,以单细胞RNA测序检验预测。团队称,转录组与形态学检测显示,所筛选的干预使老年细胞向年轻细胞状态偏移。

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报道时间线

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10月23日
  1. 预印本 · 单细胞与空间组学
    衰老人类成纤维细胞中因果性基因相互作用的推断与验证

    研究利用收敛交叉映射(CCM)分析490名GTEx供者的横断面转录组数据,推断衰老相关基因因果网络,并经实验验证部分预测。对55岁供者成纤维细胞进行单基因过表达后,单细胞RNA测序验证了53.8%的可检验预测相互作用。转录组与形态学检测显示,CCM筛选的干预使老年细胞向年轻细胞状态偏移。

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