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Nucleic Acids Research·· 11 小时前AI 评分38

使用 BBERT 快速准确地对宏基因组短读段进行分类域归属判定

Fast and accurate taxonomic domain assignment of short metagenomic reads using BBERT

AI 导读

BBERT 是针对短读段优化的核苷酸大语言模型,可不依赖参考数据库,准确判定短至 100 bp 读段的分类域、编码潜能和阅读框。在大批土壤宏基因组中测试显示,该模型可将短读段直接转为细菌氨基酸序列。野生豆科植物根瘤宏基因组验证显示,BBERT 过滤可改善分箱质量并显著加快从头组装。

来源:Nucleic Acids Research · academic.oup.com