预印本 · 单细胞与空间组学· Chen C, Borm LE, Pascual-Reguant A, Ruano I, Risso D, Crowell HL.·· 1 天前AI 评分46
成像空间转录组学技术偏倚的探讨
On technical biases in imaging spatial transcriptomics
AI 导读
研究将成像空间转录组学(iST)的技术偏倚分为实验与计算两类,并提出统一计数建模框架以形式化描述这些变异来源。基于公共数据集,研究展示了样本保存、空间采样、z-stack配准及视野拼接等偏倚如何叠加并显现。研究呼吁整合理解iST数据来源、加强跨领域知识共享,以支持更稳健的实验设计和可靠的下游分析。
来源:预印本 · 单细胞与空间组学 · doi.org