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Genome Biology·· 14 小时前AI 评分50

CSDE 利用专家反馈校正空间转录组流程偏差,改善差异表达估计

Mitigating bias in spatial transcriptomic pipelines via human feedback with CSDE

AI 导读

研究提出校正空间差异表达方法 CSDE,利用少量经专家核验的细胞,校正空间转录组预处理中的系统性偏差。该方法基于预测驱动推断,针对细胞分割、基因表达定量和细胞类型注释中的误差;在三个案例研究中,其差异表达估计比忽略预处理偏差的常用方法更可靠。研究仅使用既往发表、公开可用的去标识化数据集,论文链接为 https://doi.org/10.1186/s13059-026-04302-9。

来源:Genome Biology · link.springer.com