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预印本 · 单细胞与空间组学· Stotzem N, Chang S, Cai N, Casale FP.·· 1 天前AI 评分40

SpaceDX联合定位与检验揭示差异表达的空间背景

Joint localization and testing reveals spatial context of differential expression

AI 导读

SpaceDX通过基因特异性注意力空间加权,联合检验差异表达并定位相关空间表达模式,无需预先划定组织区域。在小鼠慢性应激模型中,其检出的差异表达基因较区域DESeq2伪批量分析多45.8%;在小鼠阿尔茨海默病模型中,与DESeq2联用较单用DESeq2增加19.1%的发现。

来源:预印本 · 单细胞与空间组学 · doi.org