Bioinformatics (OUP)·· 11 天前AI 评分58
STiLE 仅凭细胞质心坐标实现空间转录组组织芯片自动拆分
STiLE: automated tissue microarray dearraying for spatial transcriptomics
AI 导读
STiLE 是一种空间转录组组织芯片自动拆分工具,仅凭细胞质心坐标将细胞分配至各自组织芯,无需组织学图像。该算法结合连通分量检测、HDBSCAN 聚类、分量引导的聚类合并及可选网格峰值检测,在来自三种平台的七个公共组织芯片样本(50–150 个组织芯)上达到 ARI > 0.99,在含真实场景伪影的 396 个合成数据集上平均 ARI = 0.992。
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