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预印本 · 单细胞与空间组学· Ilin M, Singh Y, Mages SW.·· 1 天前AI 评分47

尺度分辨相关函数框架 SCOTE 统一跨平台、跨分辨率的空间组学分析

Scale-resolved correlation functions unify spatial omics across platforms and resolutions

AI 导读

SCOTE计算框架量化所有特征对在各长度尺度上的空间关系,使不同平台、样本和患者的空间组学结果可比较,并区分测量效应与生物学差异。其分子级分析识别出细胞级分析遗漏的小鼠脾脏基因敲除效应。在单个GPU上,处理含十亿分子的全转录组切片、覆盖所有长度尺度并估计不确定性,耗时26分钟。

来源:预印本 · 单细胞与空间组学 · doi.org