Nucleic Acids Research·· 3 天前AI 评分42
RiboBA:一种考虑偏倚的概率框架,用于跨多种核糖体测序方案稳健识别ORF
RiboBA: a bias-aware probabilistic framework for robust ORF identification across diverse ribosome profiling protocols
AI 导读
RiboBA通过建模核糖体测序中的实验方案诱导偏倚,提高非经典开放阅读框(ncORF)的识别能力。该框架结合生成模块与监督模块,从偏倚校正后的数据中识别翻译中的ORF及起始位点。模拟、多种实测数据及正交免疫肽组学证据支持其性能,优势在周期性减弱的RNase I文库及MNase、核酸酶P1数据中尤为明显。
来源:Nucleic Acids Research · academic.oup.com