预印本 · 医学生信与数据分析· Narayan V, Merritt B, Choudhery S, Jimenez D, Ta S, Berman DS, Ratcliff J, Gallagher ME.·· 1 天前AI 评分52
MicrobeRT 发布基因组语言模型框架,用于宏基因组物种鉴定、耐药基因检测与致病性评估
MicrobeRT: A Framework and Suite of Fine-tuned Language Models for Genomic Sequences
AI 导读
MicrobeRT 是一个开源基因组语言模型框架,通过微调模型完成宏基因组测序读段的物种级鉴定、抗生素耐药基因检测和致病性评估。框架基于 Nucleotide Transformer、DNABERT 和 HyenaDNA,微调数据涵盖超过 500,000 个基因组及 250,000 条抗生素耐药基因序列。
来源:预印本 · 医学生信与数据分析 · doi.org