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研究团队提出LOTUS,结合谱系信息重建细胞命运

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AI 综述

Lu J等研究团队在预印本中提出谱系感知最优传输框架LOTUS,将时间序列单细胞转录组快照与克隆谱系信息结合,用于重建连续的细胞命运动态。在分支模拟中,LOTUS将偏离目标的传输比例从基准方法的4.94%–14.84%降至1.10%。 在造血、成纤维细胞重编程及疟疾应答记忆CD4+ T细胞数据中,研究团队利用该框架重建了分支轨迹、区分了重编程成功与失败路径,并保留了内源性克隆型结构。

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报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

11月3日
  1. 预印本 · 单细胞与空间组学
    LOTUS:谱系感知最优传输重建连续克隆命运动态

    LOTUS整合时间序列单细胞转录组快照与克隆谱系信息,重建连续的细胞命运动态。在分支模拟中,相较基准方法,LOTUS将偏离目标的传输比例从4.94-14.84%降至1.10%。在造血、成纤维细胞重编程及疟疾应答记忆CD4+ T细胞数据中,该框架重建了分支轨迹、区分了重编程成功与失败路径,并保留了内源性克隆型结构。

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还没有足够的连续观测数据,暂不绘制趋势。