LOTUS：谱系感知最优传输重建连续克隆命运动态

LOTUS整合时间序列单细胞转录组快照与克隆谱系信息，重建连续的细胞命运动态。在分支模拟中，相较基准方法，LOTUS将偏离目标的传输比例从4.94-14.84%降至1.10%。在造血、成纤维细胞重编程及疟疾应答记忆CD4+ T细胞数据中，该框架重建了分支轨迹、区分了重编程成功与失败路径，并保留了内源性克隆型结构。