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研究团队提出EMBER,支持跨细胞情境扰动预测

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AI 综述

Ho N、Xing EP和Ma J研究团队提出基因表征基础模型EMBER,预印本报告其在跨细胞情境的扰动反应预测和遗传相互作用排序中优于所评估的基线方法。 EMBER学习基因在不同情境下的功能表征,固定预训练编码器,再用轻量预测模块组合这些表征,支持单基因扰动、双基因相互作用及多靶点药物反应预测。模型还将参与自噬体与溶酶体融合的SCFD1列为mTOR抑制期间的候选依赖基因,供实验验证。

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报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

10月31日
  1. 预印本 · 单细胞与空间组学
    EMBER:情境化基因表征支持跨细胞扰动的组合预测

    基因中心基础模型EMBER利用情境依赖的基因表征,在跨情境扰动反应预测和遗传相互作用排序上优于所评估的基线方法。同一套预训练表征支持单基因扰动反应、双基因相互作用及多靶点药物反应预测。模型还将参与自噬体与溶酶体融合的SCFD1列为mTOR抑制期间的候选依赖基因,供实验验证。

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