预印本 · 单细胞与空间组学· Ho N, Xing EP, Ma J.·2026-10-31 08:00· 1 天前AI 评分38

EMBER：情境化基因表征支持跨细胞扰动的组合预测

EMBER: Contextualized gene representations enable compositional prediction across cellular perturbations

AI 导读

基因中心基础模型EMBER利用情境依赖的基因表征，在跨情境扰动反应预测和遗传相互作用排序上优于所评估的基线方法。同一套预训练表征支持单基因扰动反应、双基因相互作用及多靶点药物反应预测。模型还将参与自噬体与溶酶体融合的SCFD1列为mTOR抑制期间的候选依赖基因，供实验验证。