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Alpha Spatial以语言引导预测细胞级空间基因表达

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AI 综述

YANG X等研究团队在预印本中提出Alpha Spatial,通过语言引导和跨组织、跨基因面板联合学习,从组织学图像预测细胞级基因表达,在研究评估中优于所比较的方法。匹配的生物学背景可改善预测,不兼容的背景则降低准确性。 在乳腺癌分析中,该框架重现了POSTN相关基质程序及HER2相关分子与空间差异。探索性患者分析还发现,CXCL14相关空间状态的丰度与含曲妥珠单抗治疗无应答及更大的残余浸润性肿瘤相关。

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报道时间线

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10月15日
  1. 预印本 · 单细胞与空间组学
    Alpha Spatial:语言引导的基于组织学图像的单细胞空间基因表达预测

    Alpha Spatial通过语言引导,从组织学图像预测细胞级基因表达,表现优于所评估方法。匹配的生物学背景与多组织联合学习改善预测;在乳腺癌中,该框架重现了POSTN相关基质程序及HER2相关分子与空间差异。探索性患者分析显示,CXCL14相关空间状态的丰度与含曲妥珠单抗(trastuzumab)治疗无应答及更大残余浸润性肿瘤相关。

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