研究团队提出空间转录组细胞分割框架Tracel

Zhang J等研究团队在预印本中提出Tracel，借助匹配的单细胞RNA测序参考，将空间转录组观测值重新分配至细胞，可用于修正已有分割，或从细胞核分割结果出发进行细胞分割。 该框架采用两阶段最优传输方法：先对齐参考细胞与空间细胞，估计各细胞位置的预期表达谱，再据此分配转录本。同一框架适用于Xenium、CosMx的成像转录本，以及Visium HD的分箱计数。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。