研究团队提出单细胞轨迹评估工具BioTrajX
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研究团队提出单细胞轨迹评估工具BioTrajX
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AI 综述
Li TY、Chang Y、Chen S在预印本中提出R包BioTrajX，用三项指标评估单细胞拟时序轨迹是否符合预期生物学过程。 三项指标分别检查拟时序方向与预期生物学进程是否一致、标志物程序沿轨迹的变化是否连贯，以及轨迹终点是否富集预期细胞状态。研究团队称，该工具可用于比较不同轨迹推断结果，并在下游分析前评估根细胞选择。
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最新进展11月4日 08:00
BioTrajX：评估单细胞轨迹推断的生物学合理性报道时间线
沿着报道，了解事件的不同侧面。
11月4日
- 预印本 · 单细胞与空间组学BioTrajX：评估单细胞轨迹推断的生物学合理性
BioTrajX是一款R包，通过方向性、顺序一致性和终点有效性三项互补指标，评估单细胞拟时序轨迹的生物学合理性。这些指标分别衡量拟时序与预期生物学进程的一致程度、标志物程序变化的连贯性及轨迹终点预期细胞状态的富集情况，可用于比较不同轨迹推断结果，并在下游分析前评估根细胞选择。
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