预印本 · 单细胞与空间组学· Li TY, Chang Y, Chen S.·· 1 天前AI 评分40
BioTrajX:评估单细胞轨迹推断的生物学合理性
BioTrajX: evaluating biological plausibility in single-cell trajectory inference
AI 导读
BioTrajX是一款R包,通过方向性、顺序一致性和终点有效性三项互补指标,评估单细胞拟时序轨迹的生物学合理性。这些指标分别衡量拟时序与预期生物学进程的一致程度、标志物程序变化的连贯性及轨迹终点预期细胞状态的富集情况,可用于比较不同轨迹推断结果,并在下游分析前评估根细胞选择。
来源:预印本 · 单细胞与空间组学 · doi.org