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研究团队提出泛癌共表达分析框架

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AI 综述

Khan SUU等研究团队在预印本中提出泛癌共表达分析框架,用于区分谱系依赖性与分析伪象;在17个TCGA队列中,研究发现PTK2与预后的关联随癌种而异,且独立于肿瘤纯度。 该框架针对任意索引基因,处理相关性阈值截断、拷贝数影响及跨癌种保守性评估。拷贝数校正后,含44个转录本的反式共表达程序保持不变,顺式对照减少38%;在243个单细胞病例中,133个可在单个肿瘤内检出共表达。

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报道时间线

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11月4日
  1. 预印本 · 单细胞与空间组学
    情境差异而非矛盾:解析一致与非一致共表达程序的泛癌框架

    一项预印本提出泛癌共表达分析框架,在17个TCGA队列中发现PTK2与预后的关联随癌种而异,且独立于肿瘤纯度。拷贝数校正后,含44个转录本的反式共表达程序不变,顺式对照减少38%;243个单细胞病例中,133个可在单个肿瘤内检出共表达。

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