研究团队开发跨平台空间转录组工作流Spatialsnake

Lin Z等研究者开发了空间转录组分析工作流Spatialsnake，并在预印本中以小鼠脑Visium和结直肠癌Visium HD数据展示其功能。 该工作流基于SpatialData和Snakemake构建，可分析Visium、Visium HD、Stereo-seq、Xenium和MERFISH平台已处理的输出数据。它支持单样本和多样本分析，允许选择细胞群、组织区域或基于距离的邻域重新聚类与注释，再将细化后的标签映射回完整数据集。

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还没有足够的连续观测数据，暂不绘制趋势。