预印本 · 单细胞与空间组学· Lin Z, zhang z, Huang N, Lu Z, Xu S.·· 2 天前AI 评分43
Spatialsnake:适用于跨平台空间转录组分析的灵活工作流
Spatialsnake: a flexible workflow for spatial transcriptomics analysis across platforms
AI 导读
Spatialsnake基于SpatialData和Snakemake构建,为测序和成像平台的空间转录组数据提供统一分析工作流。它支持单样本与多样本分析,可选择细胞群、组织区域或基于距离的邻域重新聚类和注释,并将细化标签映射回完整数据集。研究以小鼠脑和结直肠癌数据展示了这些功能。
来源:预印本 · 单细胞与空间组学 · doi.org