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单细胞分类随机划分或高估跨供者泛化能力

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AI 综述

Chen X、Li J和Battle A团队在一项预印本研究中比较单细胞分类评估方式,发现PBMC和肺数据中,随机按细胞划分得到的宏平均F1持续高于按供者留出的评估,提示前者可能高估对新供者的泛化能力。 这一差距出现在多种表达表征中,经批次协变量调整和供者层面的混合效应建模后仍存在;但在接近性能上限的肾脏、胰腺及血液基准,以及随机标签下限对照中,差距很小。研究团队据此认为,涉及未见个体泛化能力的主张,应采用供者留出评估。

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报道时间线

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10月27日
  1. 预印本 · 单细胞与空间组学
    单细胞细胞类型分类评估中,随机按细胞划分可能高估跨供者泛化能力

    一项单细胞细胞类型分类方法学评估显示,在 PBMC 和肺数据集中,随机按细胞划分得到的宏平均 F1 持续高于按供者留出的评估。该差距见于多种表达表征,经批次协变量调整和供者层面的混合效应建模后仍存在;但在接近性能上限的肾脏、胰腺及血液基准和随机标签下限对照中,差距很小。

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