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预印本 · 单细胞与空间组学· Chen X, Li J, Battle A.·· 1 天前AI 评分65

单细胞细胞类型分类评估中,随机按细胞划分可能高估跨供者泛化能力

Evaluation design shapes estimates of cross-donor generalization in single-cell classification of cell-type

AI 导读

一项单细胞细胞类型分类方法学评估显示,在 PBMC 和肺数据集中,随机按细胞划分得到的宏平均 F1 持续高于按供者留出的评估。该差距见于多种表达表征,经批次协变量调整和供者层面的混合效应建模后仍存在;但在接近性能上限的肾脏、胰腺及血液基准和随机标签下限对照中,差距很小。

来源:预印本 · 单细胞与空间组学 · doi.org