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研究团队提出转录组虚拟谱系追踪框架isCORAL

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AI 综述

Lin Y等研究团队提出isCORAL计算谱系追踪框架,仅凭单细胞和空间转录组快照推断克隆关系及细胞命运动态;预印本报告,该框架在多种谱系追踪数据集上优于所测试的其他方法。 isCORAL通过识别具有可遗传表达差异的“记忆基因”推断谱系。团队用它解析了造血干细胞的早期命运偏向,并在小鼠肿瘤空间转录组数据中,用实验记录的谱系树验证推断结果。

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报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

10月20日
  1. 预印本 · 单细胞与空间组学
    虚拟谱系:从单细胞与空间转录组进行计算机模拟谱系追踪

    isCORAL计算谱系追踪框架仅凭转录组快照重建克隆关系并映射细胞命运动态,在多种谱系追踪数据集上优于所测试的其他方法。该框架通过识别具有可遗传表达差异的记忆基因推断谱系,解析造血干细胞的早期命运偏向,并在小鼠肿瘤空间转录组中以实验记录的谱系树验证推断结果。

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