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预印本 · 单细胞与空间组学· Lin Y, Lin Y.·· 1 天前AI 评分49

虚拟谱系:从单细胞与空间转录组进行计算机模拟谱系追踪

Virtual lineages: in silico lineage tracing from single-cell and spatial transcriptomes

AI 导读

isCORAL计算谱系追踪框架仅凭转录组快照重建克隆关系并映射细胞命运动态,在多种谱系追踪数据集上优于所测试的其他方法。该框架通过识别具有可遗传表达差异的记忆基因推断谱系,解析造血干细胞的早期命运偏向,并在小鼠肿瘤空间转录组中以实验记录的谱系树验证推断结果。

来源:预印本 · 单细胞与空间组学 · doi.org