结直肠癌出芽相关基因共表达在单细胞中更清晰
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结直肠癌出芽相关基因共表达在单细胞中更清晰
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AI 综述
Sarkar P研究团队在预印本中报告,跨平台分析发现,结直肠癌肿瘤出芽相关基因AIF1、LIF、MRC1和TNC的共表达在单细胞数据中比整体转录组中更清晰,但整体转录组衍生的风险评分仅呈较弱关联(Cox HR=1.21,p=0.021)。 研究比较了547例整体RNA测序样本与26,057个单细胞的测序数据,两类数据中的基因对富集倍数分别为1.16—2.72和31—184.5。团队据此指出,研究肿瘤微环境相关基因特征时,转录组数据的分辨率会影响共表达信号的识别。
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最新进展10月16日 08:00
结直肠癌肿瘤出芽相关基因特征的跨平台评估报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
10月16日
- 预印本 · 单细胞与空间组学结直肠癌肿瘤出芽相关基因特征的跨平台评估
结直肠癌跨平台分析显示,肿瘤出芽相关基因AIF1、LIF、MRC1和TNC的共表达在单细胞数据中比整体转录组更清晰。研究纳入整体RNA测序样本547例及单细胞测序26,057个细胞,基因对富集倍数分别为1.16至2.72和31至184.5。整体转录组衍生风险评分仅呈较弱关联(Cox HR=1.21,p=0.021)。
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