研究团队开发CloneVI推断单细胞克隆结构
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研究团队开发CloneVI推断单细胞克隆结构
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AI 综述
Hibi T等研究团队开发了深度生成模型CloneVI;团队在预印本中报告,该模型在模拟数据中恢复了真实克隆结构,并在克隆性造血、慢性淋巴细胞白血病和多供者卵巢肿瘤数据中识别出相关细胞群体及分子特征。 CloneVI利用单细胞RNA测序或染色质可及性数据中的细胞状态信息,通过重建线粒体DNA突变计数,估计细胞的克隆归属概率及各克隆的等位基因频率,识别由线粒体DNA突变定义、且与细胞状态相关的群体。模型代码已在GitHub公开。
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最新进展11月4日 08:00
CloneVI 深度生成模型解析单细胞状态与线粒体基因型的关系报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月4日
- 预印本 · 单细胞与空间组学CloneVI 深度生成模型解析单细胞状态与线粒体基因型的关系
研究团队开发了深度生成模型 CloneVI,通过基因表达或染色质可及性推断克隆结构,识别由线粒体 DNA 突变定义且与细胞状态相关的群体。模型通过重建突变计数估计细胞的克隆归属概率及各克隆的等位基因频率,在模拟数据中恢复了真实克隆结构,并在克隆性造血、慢性淋巴细胞白血病和多供者卵巢肿瘤数据中识别出相关细胞群体及分子特征。
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