预印本 · 单细胞与空间组学· Peng Y, Yang L, Ge H.·· 2 天前AI 评分56
scSTEC通过二维嵌入与染色体共识直接注释单细胞Hi-C染色质亚区室
scSTEC: Annotating Chromatin Subcompartments from Individual Single-Cell Hi-C Data via Direct Two-Dimensional Embedding and Chromosome-wise Consensus
AI 导读
scSTEC可直接从单个细胞的Hi-C接触矩阵注释染色质亚区室，无需数据插补、复杂上游处理或跨细胞数据共享。研究指出scGHOST构建的估计染色体间矩阵秩为2，并据此采用二维基因组嵌入与染色体层面的共识策略，在bulk Hi-C、降采样模拟及多个人和小鼠单细胞数据集中获得与scGHOST相近的注释结果。
来源：预印本 · 单细胞与空间组学 · doi.org