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预印本 · 单细胞与空间组学· Adhisantoso YG, Schröder SK, Greß M, Hernaez M, Voges J.·· 1 天前AI 评分52

RAPTORGraph 以图通路建模支持单细胞扰动中的因果发现

RAPTORGraph: graph-based pathway modeling for causal discovery in single-cell perturbations

AI 导读

RAPTORGraph 是一种用于单细胞扰动因果发现的 β-变分自编码器,在未见扰动的非加性交互等下游分析中优于现有先进方法。其 GraphPathway 编码器建模学习所得通路内的基因间相互作用,通过预条件化隔离扰动基因的影响以消除干预溢出,并采用最优传输对齐后的数据训练,以稳定潜在表征。

来源:预印本 · 单细胞与空间组学 · doi.org