利用 CRISP 揭示单细胞与空间组学中的跨信号相互作用

CRISP 基于单细胞基因表达数据的多种信号特异性概率投影，刻画生物信号间的相互作用，并定位相关细胞亚群和基因。在可调耦合模拟及四个单细胞与空间转录组数据集中，CRISP 识别出多种信号相互作用，包括纤维化肝细胞中分区与位置耦合的丧失，以及疟原虫肝脏感染中转录延迟的肝细胞。