研究团队提出亚细胞空间分析框架InSpace
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研究团队提出亚细胞空间分析框架InSpace
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AI 综述
Niu Y、Zheng Y研究团队在预印本中提出InSpace，用于量化亚细胞分子的定位与共现，并在含2.75亿个转录本的数据集上展示了可扩展性。框架中的InSpace-R描绘转录本的径向定位，InSpace-C测量分子对随距离变化的共现或缺失。 在涵盖12种癌症的58个肿瘤数据集中，研究团队发现，B细胞和浆细胞的MHC-II转录本丰度降低，同时伴随更靠近细胞外周的定位及更强的相互共现。
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最新进展11月2日 08:00
使用 InSpace 量化从分子定位到共现的亚细胞组织特征报道时间线
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11月2日
- 预印本 · 单细胞与空间组学使用 InSpace 量化从分子定位到共现的亚细胞组织特征
InSpace 可量化亚细胞分子定位与共现，并在含 275 million 个转录本的数据集上展示了可扩展性。InSpace-R 描绘转录本径向定位，InSpace-C 测量分子对随距离变化的共现或缺失。在涵盖 12 种癌症的 58 个肿瘤数据集中，B 细胞和浆细胞的 MHC-II 转录本丰度降低伴随更外周的定位及更强的相互共现。
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