预印本 · 单细胞与空间组学· Niu Y, Zheng Y.·· 2 天前AI 评分48
使用 InSpace 量化从分子定位到共现的亚细胞组织特征
Quantifying subcellular organization from localization to co-occurrence with InSpace
AI 导读
InSpace 可量化亚细胞分子定位与共现,并在含 275 million 个转录本的数据集上展示了可扩展性。InSpace-R 描绘转录本径向定位,InSpace-C 测量分子对随距离变化的共现或缺失。在涵盖 12 种癌症的 58 个肿瘤数据集中,B 细胞和浆细胞的 MHC-II 转录本丰度降低伴随更外周的定位及更强的相互共现。
来源:预印本 · 单细胞与空间组学 · doi.org