预印本报告体细胞变异的转录组效应随细胞背景变化
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预印本报告体细胞变异的转录组效应随细胞背景变化
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AI 综述
Sun P等研究团队在预印本中报告,体细胞单核苷酸变异(SNV)相关的转录组变化随细胞类型和状态而异,基于序列的有害性预测与这些变化的一致性较低。 团队利用PrismSNV和单细胞全长转录组测序平台Ligo-Seq分析三种癌症的26份样本,发现超过60%的候选SNV呈现显著的细胞类型特异性转录组偏移,幅度差异超过30%。对655,349个CD4+ T细胞转录组的分析还显示,SNV与基因的关联强度会在细胞激活过程中改变,有时方向也会变化。
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最新进展11月2日 08:00
细胞背景塑造体细胞变异对转录组的影响报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月2日
- 预印本 · 单细胞与空间组学细胞背景塑造体细胞变异对转录组的影响
PrismSNV与单细胞全长转录组测序平台Ligo-Seq分析显示,体细胞SNV相关转录组变化具有细胞类型特异性。在三种癌症的26份样本中,超过60%的候选SNV呈现显著的细胞类型特异性转录组偏移,幅度差异超过30%。基于序列的有害性预测与细胞转录组偏移的一致性较低。
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