预印本 · 单细胞与空间组学· Sun P, Jia P, Lou C, Li X, Li M, Zhang R, Lin H, Li X, Zhou Y, Cai S, Zhang Z, Zhang P, Xu T, Wang S, Wang Y, Li M, Gong Y, Sang G, Yin J, Li J, Xie Q, Yue Z, Xu D, Yang X, Bush SJ, Geng S, Meng D, Li X, Ye K.·· 2 天前AI 评分46
细胞背景塑造体细胞变异对转录组的影响
Cellular context shapes the transcriptomic impact of somatic variants
AI 导读
PrismSNV与单细胞全长转录组测序平台Ligo-Seq分析显示,体细胞SNV相关转录组变化具有细胞类型特异性。在三种癌症的26份样本中,超过60%的候选SNV呈现显著的细胞类型特异性转录组偏移,幅度差异超过30%。基于序列的有害性预测与细胞转录组偏移的一致性较低。
来源:预印本 · 单细胞与空间组学 · doi.org