从空间转录组数据推断体细胞拷贝数异常以研究癌症早期发展

研究者开发了直接从Xenium空间转录组数据推断体细胞拷贝数异常的计算框架，可识别并定位具有共同异常谱的细胞群。在卵巢癌、宫颈癌和乳腺癌数据集中，该框架识别出空间连贯的异常细胞群，重现已知肿瘤相关拷贝数异常及病理状态。在高级别浆液性卵巢癌中，发现输卵管内具有早期转化特征、伴免疫重塑的中间上皮细胞群。