预印本 · 单细胞与空间组学· You L, Durbin JL, Meng G, Stallaert W, Li G, Uttam S, Feng H, Glausier JR, Wang J.·· 1 天前AI 评分54
SPInfer 通过微调细胞分割模型改善人脑组织群体尺度空间蛋白组推断
Overcoming segmentation bottlenecks in brain tissue for spatial proteomic inference at population scale
AI 导读
SPInfer 工作流通过微调 Cellpose-SAM,将人脑组织细胞分割 F1 从 0.37 提升至 0.84,用于群体尺度空间蛋白组推断。研究基于人前额叶皮层 120 张免疫荧光图像中 5,832 个手工标注胞体开发流程,并比较了八种分割方法,微调后恢复的细胞组成与配对单核 RNA-seq 及空间转录组结果一致。
来源:预印本 · 单细胞与空间组学 · doi.org