预印本 · 单细胞与空间组学· Cupaioli FA, Merelli I.·· 1 天前AI 评分69
单细胞基础模型基准评测：跨物种注释显优势，同物种注释与主成分基线相近
Where single-cell foundation models help: a benchmark of annotation, perturbation and regulatory inference against simple baselines
AI 导读
一项比较五种单细胞基础模型、CellOracle、监督式扰动模型及简单基线的预印本显示，基础模型的优势主要体现在跨物种细胞类型注释。人到小鼠肺的标签迁移中，Nicheformer准确率达0.98，Geneformer V2和scFoundation约为0.90，最佳基线为0.68；同物种内，基础模型嵌入的注释准确性与主成分相近。
来源：预印本 · 单细胞与空间组学 · doi.org