预印本 · 单细胞与空间组学· Zhang L, Chen Y, Zhong Q, Xu W.·· 1 天前AI 评分61
U-Chrom 提供统一单细胞与空间三维基因组数据的框架
U-Chrom: a unified framework for single-cell and spatial 3D genome data
AI 导读
U-Chrom 通过统一数据模型 ChromData,按细胞和基因组区段索引单细胞 Hi-C、空间 Hi-C 与染色质追踪数据。该模型配套开源工具包、关联浏览器及包含 22 个数据集的图谱。在涵盖三类技术的十个小鼠脑数据集中,同一套分析按短程相对长程接近程度得到一致的细胞类型排序,基于接触数据的重建所定位的细胞类型差异与成像结果大体一致。
来源:预印本 · 单细胞与空间组学 · doi.org